根据湖北出入境检验检疫局《襄樊出入境检验检疫局内设科室和人员编制的批复》（鄂检人[1999]126号），内设机构与职责如下：
（一） 办公室：
　　协助局领导协调机关日常工作和督察督办，组织重要会议和活动，负责财务、政工、人事、监察、后勤、秘书、保密、档案、信息宣传、安全保卫等工作，完成局领导交办的其它工作。
（二） 综合业务科
　　负责有关检验检疫法规工作及执法督查、稽查工作，承办行政处罚、复议、诉讼和协助司法调查及法制宣传教育，负责全局的检验检疫业务质量管理工作，负责科技管理、负责外商投资财产价值鉴定工作，负责市场抽查与监管等工作，负责管理和接受申请进出口卫生注册、检疫注册和进出口安全质量许可工作等。
（三） 一科
　　负责出入境动植物及其产品和其它应检物的检验检疫和监督管理，参与出入境动植物及其产品的卫生和检疫注册的考核与监督检查，负责出入境卫生检疫和监督管理，负责进出口食品等商品的卫生、质量检验和监督管理，参与进出口食品卫生注册的考核和监督检查，负责进出口化工矿产品、冶金产品等商品的法定检验和监督管理，参与对分管商品的进出口安全质量许可的考核和监督检查，负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
（四） 二科
　　负责进出口机电仪、成套设备、车辆、机电类轻工产品、出口包装及包装材料等商品的法定检验和监督管理，参与分管商品的进出口安全质量许可的考核和监督检查，负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
（五） 三科
　　负责进出口纺织原料及制品等商品的法定检验和监督管理，参与分管的进出口商品安全质量许可的考核和监督检查、负责上述工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
（六） 检务科
　　负责出入境检验检疫证书、证单的签发工作，负责检验检疫报检、计费、签证、放行及流程管理，负责普惠制原产地证和一般原产地证的签发和监督管理，负责检验检疫业务统计和计算机信息系统的管理工作。
（七） 实验室
　　本实验室隶属于襄樊检验检疫局，成立于1990年03月，是原CCIBLAC(现CNAL,中国国家实验室认可委员会)注册实验室。
　　本实验室具备化学、物理和微生物的检测功能，拥有一大批国际国内先进水平的仪器设备，如Z-8200日立原子吸收分光光度计，HF-140碳硫分析仪等。检测商品范围包括农副土特、粮油食品、冶金、化工、矿产、纺织、服装、包装等。
　　本实验室除承担法定的进出口货物和包装的检验检疫外，还提供公共技术服务，如产品检测鉴定、实验室设计建设、实验室人员培训。
　　本室欢迎有识、有为之士光临指导。
（八） 十堰办事处
负责襄樊局指定的十堰地区、神农架林区出入境货物检验检疫和监督管理工作，负责所作工作的业务统计、质量分析和信息收集工作。
（九） ISO9000咨询分中心
　　负责襄樊局与企业签订的ISO9000咨询服务工作，负责与湖北评审中心联系搞好咨询厂家的评审认证工作，负责咨询厂家的统计、分析和信息收集工作。